在“十一五”水专项（2008ZX07102－001）的支持下，北京大学团队对滇池流域污染特征与富营养化开展了系统的调查、诊断与评估。研究结果表明，单纯的流域污染负荷与水质改善在降低周年性蓝藻暴发时面临困境，滇池治理的战略目标必须发生转换，即应坚持水质目标和生态目标并重，且生态系统健康应是滇池恢复的重要目标。在此战略目标的指引下，滇池水污染防治与富营养化控制规划方案的总体思路为：以实现滇池水质持续性改善和生态系统草型清水稳态为中长期规划的总体目标，以流域水环境承载力与容量总量控制为约束，通过构建3个尺度、8个分区及4个规划重点的流域污染减排（抑增减负）与湖体生态修复集成方案体系及情景方案，为滇池水质恢复及分步、分区生态修复提供流域控源、湖滨生境及外部条件。
